Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc97Q9DBT3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc97Q9DBT3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc97Q9DBT3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms