Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Atp5oQ9DB20 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp5oQ9DB20 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp5oQ9DB20 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp5oQ9DB20 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp5oQ9DB20 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp5oQ9DB20 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp5oQ9DB20 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp5oQ9DB20 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp5oQ9DB20 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp5oQ9DB20 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp5oQ9DB20 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp5oQ9DB20 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp5oQ9DB20 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp5oQ9DB20 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp5oQ9DB20 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp5oQ9DB20 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp5oQ9DB20 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp5oQ9DB20 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp5oQ9DB20 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp5oQ9DB20 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms