Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAH2

Znrf4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf4Q9DAH2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Znrf4Q9DAH2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znrf4Q9DAH2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znrf4Q9DAH2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znrf4Q9DAH2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znrf4Q9DAH2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znrf4Q9DAH2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znrf4Q9DAH2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Znrf4Q9DAH2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Znrf4Q9DAH2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znrf4Q9DAH2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znrf4Q9DAH2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znrf4Q9DAH2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znrf4Q9DAH2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Znrf4Q9DAH2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Znrf4Q9DAH2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znrf4Q9DAH2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Znrf4Q9DAH2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znrf4Q9DAH2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znrf4Q9DAH2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Znrf4Q9DAH2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znrf4Q9DAH2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znrf4Q9DAH2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Znrf4Q9DAH2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Znrf4Q9DAH2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znrf4Q9DAH2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Znrf4Q9DAH2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Znrf4Q9DAH2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Znrf4Q9DAH2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms