Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc89Q9DA73 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccdc89Q9DA73 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc89Q9DA73 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc89Q9DA73 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc89Q9DA73 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc89Q9DA73 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc89Q9DA73 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc89Q9DA73 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc89Q9DA73 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc89Q9DA73 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc89Q9DA73 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc89Q9DA73 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc89Q9DA73 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc89Q9DA73 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc89Q9DA73 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc89Q9DA73 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc89Q9DA73 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc89Q9DA73 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc89Q9DA73 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc89Q9DA73 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc89Q9DA73 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc89Q9DA73 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc89Q9DA73 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc89Q9DA73 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc89Q9DA73 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms