Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9I4

Tbc1d20, TBC1 domain family member 20, mousemouse

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d20Q9D9I4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbc1d20Q9D9I4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d20Q9D9I4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tbc1d20Q9D9I4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d20Q9D9I4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d20Q9D9I4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d20Q9D9I4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d20Q9D9I4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d20Q9D9I4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d20Q9D9I4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d20Q9D9I4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d20Q9D9I4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d20Q9D9I4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d20Q9D9I4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d20Q9D9I4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d20Q9D9I4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d20Q9D9I4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d20Q9D9I4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d20Q9D9I4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d20Q9D9I4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d20Q9D9I4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d20Q9D9I4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d20Q9D9I4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d20Q9D9I4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d20Q9D9I4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.5 ms