Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9C0

1700109H08Rik, RIKEN cDNA 1700109H08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700109H08RikQ9D9C0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700109H08RikQ9D9C0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
1700109H08RikQ9D9C0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
1700109H08RikQ9D9C0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
1700109H08RikQ9D9C0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 194.3 ms