Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snx5Q9D8U8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx5Q9D8U8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx5Q9D8U8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms