Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
U2af1Q9D883 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
U2af1Q9D883 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
U2af1Q9D883 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
U2af1Q9D883 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms