Protein–RNA interactions for Protein: Q9D869

Chp2, Calcineurin B homologous protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp2Q9D869 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chp2Q9D869 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Chp2Q9D869 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Chp2Q9D869 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms