Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Capn9Q9D805 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Capn9Q9D805 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Capn9Q9D805 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Capn9Q9D805 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms