Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D727 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D727 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D727 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D727 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D727 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D727 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q9D727 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D727 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D727 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D727 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D727 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D727 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D727 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D727 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q9D727 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D727 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D727 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D727 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D727 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D727 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D727 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D727 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q9D727 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D727 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D727 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D727 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D727 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q9D727 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D727 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D727 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D727 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q9D727 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D727 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D727 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D727 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D727 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D727 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D727 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D727 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q9D727 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D727 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D727 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D727 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D727 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D727 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D727 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D727 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D727 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D727 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q9D727 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D727 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D727 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D727 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D727 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D727 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D727 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D727 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q9D727 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D727 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D727 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D727 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D727 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D727 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D727 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q9D727 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D727 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D727 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D727 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D727 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D727 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D727 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D727 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D727 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D727 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D727 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D727 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D727 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D727 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D727 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D727 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D727 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D727 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D727 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D727 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D727 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D727 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D727 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D727 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D727 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D727 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D727 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D727 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D727 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D727 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D727 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D727 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D727 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D727 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D727 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms