Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc9bQ9D6E4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ttc9bQ9D6E4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ttc9bQ9D6E4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms