Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6B9

Hrct1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hrct1Q9D6B9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hrct1Q9D6B9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hrct1Q9D6B9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hrct1Q9D6B9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hrct1Q9D6B9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hrct1Q9D6B9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hrct1Q9D6B9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hrct1Q9D6B9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hrct1Q9D6B9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hrct1Q9D6B9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hrct1Q9D6B9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hrct1Q9D6B9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hrct1Q9D6B9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hrct1Q9D6B9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hrct1Q9D6B9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hrct1Q9D6B9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms