Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V5

Cul5, Cullin-5, mousemouse

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Length 780 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul5Q9D5V5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul5Q9D5V5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul5Q9D5V5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul5Q9D5V5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms