Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc7Q9D541 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc7Q9D541 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Ccdc7Q9D541 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc7Q9D541 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms