Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccdc83Q9D4V3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc83Q9D4V3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc83Q9D4V3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms