Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4931428L18RikQ9D4S9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
4931428L18RikQ9D4S9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4931428L18RikQ9D4S9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4931428L18RikQ9D4S9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms