Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4930578G10RikQ9D4Q4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
4930578G10RikQ9D4Q4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
4930578G10RikQ9D4Q4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4930578G10RikQ9D4Q4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.8 ms