Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ribc2Q9D4Q1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Ribc2Q9D4Q1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ribc2Q9D4Q1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms