Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H4

Amotl1, Angiomotin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amotl1Q9D4H4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Amotl1Q9D4H4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Amotl1Q9D4H4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Amotl1Q9D4H4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Amotl1Q9D4H4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Amotl1Q9D4H4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Amotl1Q9D4H4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Amotl1Q9D4H4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Amotl1Q9D4H4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Amotl1Q9D4H4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Amotl1Q9D4H4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Amotl1Q9D4H4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Amotl1Q9D4H4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Amotl1Q9D4H4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Amotl1Q9D4H4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Amotl1Q9D4H4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Amotl1Q9D4H4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Amotl1Q9D4H4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Amotl1Q9D4H4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Amotl1Q9D4H4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Amotl1Q9D4H4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Amotl1Q9D4H4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Amotl1Q9D4H4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Amotl1Q9D4H4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Amotl1Q9D4H4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Amotl1Q9D4H4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Amotl1Q9D4H4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Amotl1Q9D4H4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Amotl1Q9D4H4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Amotl1Q9D4H4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Amotl1Q9D4H4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Amotl1Q9D4H4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Amotl1Q9D4H4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Amotl1Q9D4H4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Amotl1Q9D4H4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Amotl1Q9D4H4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Amotl1Q9D4H4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Amotl1Q9D4H4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Amotl1Q9D4H4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Amotl1Q9D4H4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Amotl1Q9D4H4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Amotl1Q9D4H4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Amotl1Q9D4H4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Amotl1Q9D4H4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Amotl1Q9D4H4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms