Protein–RNA interactions for Protein: Q9D478

Odf2l, Outer dense fiber protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2lQ9D478 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Odf2lQ9D478 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Odf2lQ9D478 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Odf2lQ9D478 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Odf2lQ9D478 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Odf2lQ9D478 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Odf2lQ9D478 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Odf2lQ9D478 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Odf2lQ9D478 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Odf2lQ9D478 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Odf2lQ9D478 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Odf2lQ9D478 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Odf2lQ9D478 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Odf2lQ9D478 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Odf2lQ9D478 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Odf2lQ9D478 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Odf2lQ9D478 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Odf2lQ9D478 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Odf2lQ9D478 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Odf2lQ9D478 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Odf2lQ9D478 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Odf2lQ9D478 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Odf2lQ9D478 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Odf2lQ9D478 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Odf2lQ9D478 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Odf2lQ9D478 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Odf2lQ9D478 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Odf2lQ9D478 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Odf2lQ9D478 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Odf2lQ9D478 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Odf2lQ9D478 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Odf2lQ9D478 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Odf2lQ9D478 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Odf2lQ9D478 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Odf2lQ9D478 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Odf2lQ9D478 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Odf2lQ9D478 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Odf2lQ9D478 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Odf2lQ9D478 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Odf2lQ9D478 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms