Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpn3Q9D3W4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpn3Q9D3W4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpn3Q9D3W4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpn3Q9D3W4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms