Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Creb3l4Q9D2A5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Creb3l4Q9D2A5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Creb3l4Q9D2A5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Creb3l4Q9D2A5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Creb3l4Q9D2A5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Creb3l4Q9D2A5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Creb3l4Q9D2A5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Creb3l4Q9D2A5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Creb3l4Q9D2A5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Creb3l4Q9D2A5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Creb3l4Q9D2A5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Creb3l4Q9D2A5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3l4Q9D2A5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3l4Q9D2A5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3l4Q9D2A5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3l4Q9D2A5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3l4Q9D2A5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Creb3l4Q9D2A5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Creb3l4Q9D2A5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Creb3l4Q9D2A5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Creb3l4Q9D2A5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Creb3l4Q9D2A5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Creb3l4Q9D2A5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Creb3l4Q9D2A5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms