Protein–RNA interactions for Protein: Q9D279

Misp, Mitotic interactor and substrate of PLK1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MispQ9D279 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MispQ9D279 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MispQ9D279 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MispQ9D279 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MispQ9D279 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MispQ9D279 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MispQ9D279 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MispQ9D279 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MispQ9D279 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MispQ9D279 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MispQ9D279 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MispQ9D279 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MispQ9D279 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MispQ9D279 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MispQ9D279 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MispQ9D279 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MispQ9D279 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MispQ9D279 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MispQ9D279 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MispQ9D279 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MispQ9D279 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MispQ9D279 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MispQ9D279 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MispQ9D279 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MispQ9D279 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MispQ9D279 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MispQ9D279 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MispQ9D279 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MispQ9D279 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MispQ9D279 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MispQ9D279 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MispQ9D279 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms