Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1T0

Lingo1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo1Q9D1T0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lingo1Q9D1T0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Lingo1Q9D1T0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lingo1Q9D1T0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lingo1Q9D1T0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lingo1Q9D1T0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Lingo1Q9D1T0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lingo1Q9D1T0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lingo1Q9D1T0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms