Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2cQ9D1C1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ube2cQ9D1C1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ube2cQ9D1C1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms