Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Arv1Q9D0U9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arv1Q9D0U9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arv1Q9D0U9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arv1Q9D0U9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arv1Q9D0U9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arv1Q9D0U9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arv1Q9D0U9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arv1Q9D0U9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arv1Q9D0U9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arv1Q9D0U9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arv1Q9D0U9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Arv1Q9D0U9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arv1Q9D0U9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arv1Q9D0U9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arv1Q9D0U9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arv1Q9D0U9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arv1Q9D0U9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms