Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0E3

Lysmd1, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd1Q9D0E3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lysmd1Q9D0E3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lysmd1Q9D0E3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lysmd1Q9D0E3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lysmd1Q9D0E3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lysmd1Q9D0E3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lysmd1Q9D0E3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lysmd1Q9D0E3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lysmd1Q9D0E3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lysmd1Q9D0E3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lysmd1Q9D0E3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lysmd1Q9D0E3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lysmd1Q9D0E3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lysmd1Q9D0E3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lysmd1Q9D0E3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lysmd1Q9D0E3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lysmd1Q9D0E3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lysmd1Q9D0E3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lysmd1Q9D0E3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lysmd1Q9D0E3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lysmd1Q9D0E3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lysmd1Q9D0E3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lysmd1Q9D0E3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lysmd1Q9D0E3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lysmd1Q9D0E3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lysmd1Q9D0E3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lysmd1Q9D0E3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lysmd1Q9D0E3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lysmd1Q9D0E3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lysmd1Q9D0E3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lysmd1Q9D0E3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lysmd1Q9D0E3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lysmd1Q9D0E3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lysmd1Q9D0E3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lysmd1Q9D0E3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lysmd1Q9D0E3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Lysmd1Q9D0E3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lysmd1Q9D0E3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lysmd1Q9D0E3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lysmd1Q9D0E3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lysmd1Q9D0E3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lysmd1Q9D0E3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lysmd1Q9D0E3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lysmd1Q9D0E3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms