Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mms19Q9D071 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mms19Q9D071 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mms19Q9D071 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms