Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Thumpd2Q9CZB3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Thumpd2Q9CZB3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Thumpd2Q9CZB3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.2 ms