Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cxxc1Q9CWW7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cxxc1Q9CWW7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cxxc1Q9CWW7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cxxc1Q9CWW7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms