Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Malsu1Q9CWV0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Malsu1Q9CWV0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Malsu1Q9CWV0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms