Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Cnot11Q9CWN7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cnot11Q9CWN7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Cnot11Q9CWN7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
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Cnot11Q9CWN7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Cnot11Q9CWN7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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Cnot11Q9CWN7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Cnot11Q9CWN7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Cnot11Q9CWN7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cnot11Q9CWN7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnot11Q9CWN7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnot11Q9CWN7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnot11Q9CWN7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnot11Q9CWN7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnot11Q9CWN7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cnot11Q9CWN7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnot11Q9CWN7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cnot11Q9CWN7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnot11Q9CWN7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnot11Q9CWN7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cnot11Q9CWN7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnot11Q9CWN7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cnot11Q9CWN7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Cnot11Q9CWN7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms