Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Otud1Q9CUB6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Otud1Q9CUB6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Otud1Q9CUB6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Otud1Q9CUB6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Otud1Q9CUB6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Otud1Q9CUB6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms