Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRW3

UPF0538 protein C2orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRW3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CRW3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CRW3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CRW3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CRW3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CRW3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CRW3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CRW3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CRW3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9CRW3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9CRW3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CRW3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CRW3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CRW3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRW3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRW3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRW3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CRW3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9CRW3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CRW3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CRW3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CRW3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q9CRW3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q9CRW3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms