Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ska2Q9CR46 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ska2Q9CR46 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ska2Q9CR46 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ska2Q9CR46 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms