Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR08

Pop4, Ribonuclease P protein subunit p29, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop4Q9CR08 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pop4Q9CR08 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pop4Q9CR08 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pop4Q9CR08 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Pop4Q9CR08 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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