Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ykt6Q9CQW1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ykt6Q9CQW1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ykt6Q9CQW1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ykt6Q9CQW1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms