Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mrpl11Q9CQF0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mrpl11Q9CQF0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Mrpl11Q9CQF0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Mrpl11Q9CQF0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Mrpl11Q9CQF0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms