Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ergic3Q9CQE7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ergic3Q9CQE7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ergic3Q9CQE7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ergic3Q9CQE7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ergic3Q9CQE7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ergic3Q9CQE7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ergic3Q9CQE7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ergic3Q9CQE7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ergic3Q9CQE7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ergic3Q9CQE7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ergic3Q9CQE7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ergic3Q9CQE7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ergic3Q9CQE7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ergic3Q9CQE7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ergic3Q9CQE7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ergic3Q9CQE7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ergic3Q9CQE7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ergic3Q9CQE7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ergic3Q9CQE7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ergic3Q9CQE7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ergic3Q9CQE7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ergic3Q9CQE7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ergic3Q9CQE7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms