Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab5aQ9CQD1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab5aQ9CQD1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rab5aQ9CQD1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms