Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chchd1Q9CQA6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chchd1Q9CQA6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chchd1Q9CQA6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chchd1Q9CQA6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chchd1Q9CQA6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chchd1Q9CQA6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chchd1Q9CQA6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chchd1Q9CQA6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chchd1Q9CQA6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chchd1Q9CQA6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chchd1Q9CQA6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chchd1Q9CQA6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chchd1Q9CQA6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chchd1Q9CQA6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chchd1Q9CQA6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chchd1Q9CQA6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chchd1Q9CQA6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chchd1Q9CQA6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chchd1Q9CQA6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Chchd1Q9CQA6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Chchd1Q9CQA6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Chchd1Q9CQA6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms