Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Ubl4bQ9CQ84 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
Ubl4bQ9CQ84 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Ubl4bQ9CQ84 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Ubl4bQ9CQ84 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
Ubl4bQ9CQ84 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Ubl4bQ9CQ84 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ubl4bQ9CQ84 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ubl4bQ9CQ84 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Ubl4bQ9CQ84 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ubl4bQ9CQ84 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ubl4bQ9CQ84 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ubl4bQ9CQ84 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Ubl4bQ9CQ84 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ubl4bQ9CQ84 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ubl4bQ9CQ84 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ubl4bQ9CQ84 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Ubl4bQ9CQ84 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Ubl4bQ9CQ84 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
Ubl4bQ9CQ84 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Ubl4bQ9CQ84 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ubl4bQ9CQ84 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Ubl4bQ9CQ84 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ubl4bQ9CQ84 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ubl4bQ9CQ84 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ubl4bQ9CQ84 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ubl4bQ9CQ84 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ubl4bQ9CQ84 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Ubl4bQ9CQ84 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ubl4bQ9CQ84 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ubl4bQ9CQ84 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ubl4bQ9CQ84 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ubl4bQ9CQ84 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Ubl4bQ9CQ84 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Ubl4bQ9CQ84 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ubl4bQ9CQ84 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Ubl4bQ9CQ84 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ubl4bQ9CQ84 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ubl4bQ9CQ84 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ubl4bQ9CQ84 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ubl4bQ9CQ84 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Ubl4bQ9CQ84 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Ubl4bQ9CQ84 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ubl4bQ9CQ84 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Ubl4bQ9CQ84 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Ubl4bQ9CQ84 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Ubl4bQ9CQ84 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Ubl4bQ9CQ84 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ubl4bQ9CQ84 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Ubl4bQ9CQ84 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ubl4bQ9CQ84 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ubl4bQ9CQ84 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Ubl4bQ9CQ84 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Ubl4bQ9CQ84 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ubl4bQ9CQ84 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ubl4bQ9CQ84 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ubl4bQ9CQ84 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ubl4bQ9CQ84 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Ubl4bQ9CQ84 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ubl4bQ9CQ84 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ubl4bQ9CQ84 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ubl4bQ9CQ84 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Ubl4bQ9CQ84 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ubl4bQ9CQ84 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Ubl4bQ9CQ84 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
Ubl4bQ9CQ84 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Ubl4bQ9CQ84 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
Ubl4bQ9CQ84 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Ubl4bQ9CQ84 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ubl4bQ9CQ84 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ubl4bQ9CQ84 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ubl4bQ9CQ84 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Ubl4bQ9CQ84 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ubl4bQ9CQ84 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ubl4bQ9CQ84 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ubl4bQ9CQ84 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ubl4bQ9CQ84 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ubl4bQ9CQ84 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Ubl4bQ9CQ84 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
Ubl4bQ9CQ84 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ubl4bQ9CQ84 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ubl4bQ9CQ84 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ubl4bQ9CQ84 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ubl4bQ9CQ84 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Ubl4bQ9CQ84 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ubl4bQ9CQ84 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ubl4bQ9CQ84 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Ubl4bQ9CQ84 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms