Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700129C05RikQ9CQ77 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
1700129C05RikQ9CQ77 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700129C05RikQ9CQ77 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700129C05RikQ9CQ77 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
1700129C05RikQ9CQ77 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
1700129C05RikQ9CQ77 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
1700129C05RikQ9CQ77 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
1700129C05RikQ9CQ77 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms