Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rpa3Q9CQ71 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rpa3Q9CQ71 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rpa3Q9CQ71 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rpa3Q9CQ71 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms