Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc198Q9CPZ1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc198Q9CPZ1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc198Q9CPZ1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 247 ms