Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU5

Acsbg1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, mousemouse

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsbg1Q99PU5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Acsbg1Q99PU5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Acsbg1Q99PU5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Acsbg1Q99PU5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Acsbg1Q99PU5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Acsbg1Q99PU5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Acsbg1Q99PU5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Acsbg1Q99PU5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Acsbg1Q99PU5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Acsbg1Q99PU5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Acsbg1Q99PU5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Acsbg1Q99PU5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Acsbg1Q99PU5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Acsbg1Q99PU5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Acsbg1Q99PU5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Acsbg1Q99PU5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Acsbg1Q99PU5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Acsbg1Q99PU5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Acsbg1Q99PU5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Acsbg1Q99PU5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Acsbg1Q99PU5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Acsbg1Q99PU5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Acsbg1Q99PU5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms