Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab27bQ99P58 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab27bQ99P58 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab27bQ99P58 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab27bQ99P58 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab27bQ99P58 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms