Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH7

Slc26a5, Prestin, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a5Q99NH7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc26a5Q99NH7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc26a5Q99NH7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc26a5Q99NH7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms