Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Rad54l2Q99NG0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Rad54l2Q99NG0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rad54l2Q99NG0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rad54l2Q99NG0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rad54l2Q99NG0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Rad54l2Q99NG0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Rad54l2Q99NG0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rad54l2Q99NG0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rad54l2Q99NG0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rad54l2Q99NG0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rad54l2Q99NG0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rad54l2Q99NG0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rad54l2Q99NG0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rad54l2Q99NG0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rad54l2Q99NG0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rad54l2Q99NG0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rad54l2Q99NG0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rad54l2Q99NG0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Rad54l2Q99NG0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rad54l2Q99NG0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rad54l2Q99NG0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rad54l2Q99NG0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rad54l2Q99NG0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rad54l2Q99NG0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rad54l2Q99NG0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rad54l2Q99NG0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rad54l2Q99NG0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rad54l2Q99NG0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rad54l2Q99NG0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rad54l2Q99NG0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rad54l2Q99NG0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rad54l2Q99NG0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Rad54l2Q99NG0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rad54l2Q99NG0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Rad54l2Q99NG0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Rad54l2Q99NG0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Rad54l2Q99NG0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Rad54l2Q99NG0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rad54l2Q99NG0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rad54l2Q99NG0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
Rad54l2Q99NG0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rad54l2Q99NG0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms